AdBlue kristallisatie in de katalysator kan in sommige omstandigheden optreden als AdBlue wordt geïnjecteerd tijdens koude cyli als de SCR katalysator onder de vereiste minimumtemperatuur voor een chemische reactie is. Als het kristallisatiepeil hoger wordt dan hetgeen bij normale motorwerking kan worden verwijderd, kan een regeneratie nodig zijn. Deze functie is een procedure die kan worden geforceerd door de diagnosetool. De functie verbrandt deeltjes die in de deeltjesfilter aanwezig zijn om dit filter te reinigen, en de AdBlue kristallen worden omgezet in gas.
Bij dit proces wordt de uitlaattemperatuur zeer hoog. Voer de regeneratie daarom buiten uit en sluit de uitlaatslang niet aan. De regeneratie maakt lawaai, gebruik gehoorbescherming. De procedure kan tot 30 - 90 minuten duren. De procedure moet worden uitgevoerd met een warme motor. De koelmiddeltemperatuur moet hoger zijn dan 60°C.