Manchmal kristallisiert das AdBlue im Katalysator, wenn es bei Kälte eingespritzt wird und die Temperatur des SCR-Katalysators unter der erforderlichen Mindesttemperatur für eine chemische Reaktion liegt. Übersteigt die Kristallisation einen bestimmten Grad, der im normalen Motorbetrieb nicht mehr entfernt werden kann, kann eine Regeneration erforderlich werden. Diese Funktion ist ein Ablauf, der vom Diagnosegerät erzwungen werden kann. Dabei werden die im Partikelfilter zurückgehaltenen Partikel verbrannt und der Filter auf diese Weise gereinigt; die AdBlue-Kristalle werden in Gas umgewandelt.
Die Abgastemperatur wird bei diesem Vorgang sehr hoch. Die Regeneration sollte daher im Freien und ohne Anschließen eines Abgasschlauchs stattfinden. Die Regeneration ist geräuschintensiv, einen Gehörschutz tragen. Der Vorgang dauert 30 - 90 Minuten. Der Vorgang muss mit warmen Motor durchgeführt werden. Die Kühlmitteltemperatur muss höher als 60 °C sein.